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伽马刀治疗最主要的优点在于它的精度，最高的机械精度，一般来说0.1mm是它的机械误差，对于颅脑疾病来说可以达到肉眼包括显微手术所不能达到的精度，对于颅内深部的病灶可以达到毫米级的治疗效果，像颅内转移性的病灶，有时候就1-2mm的大小，它也可以精确的进行照射，包括颅内一些功能性病灶的毁损，像帕金森、强迫症，它通过高精度使用很小的靶点进行照射，达到毁损局部脑组织和神经核团的目的，最终起到相当于手术的效果。伽马刀治疗的精度，对于一般手术来说是达不到的，但是它也有局限性，对于一些比较大的病灶来说，精度往往受到限制，有像胶质瘤这些大的病灶，病灶累及的范围比较广泛，这个时候跟普通的治疗需要相互结合。