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胃镜病理检查主要目的是区分病变性质，一般做胃镜后，临床医生会告诉胃镜报告是什么样的，但是临床医生如果在胃镜下看到胃里长了一个凸起的东西，临床医生只是看到东西是凸起的，它的表面是什么情况，这个病实质上是什么东西，无法判断。通过做胃镜病理检查，把这个东西取出来送到病理科，病理科做成病理切片，病理医生在镜下做诊断，凸起的东西可能是良性病变，即胃息肉；也有可能是恶性的，像淋巴瘤、胃癌或者胃的神经内分泌肿瘤，这些具体的诊断都是由病理科做普通病理切片，再外加免疫组化病理切片综合进行判断，这就是胃镜检查的目的。比方萎缩性胃炎和非萎缩性胃炎，有没有肠化、有没有溃疡，做胃镜病理检查可以明确。另外一类是看有没有恶性病变、溃疡或者凸起病变，是癌还是淋巴瘤，还是其他的恶性病变。总之，病理检查的主要目的是对病变性质起确定的作用。