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多种疾病都可以导致脑积水，比如颅脑的损伤、肿瘤，脑血管病等。微创治疗的后遗症和原发疾病本身有关，单纯的脑积水患者通过微创手术治疗效果比较好，后遗症几乎没有。如果是很复杂的原发疾病导致梗阻性脑积水，有时患者后遗症就会相对会多一些。微创治疗的后遗症和术者的操作技术及手术的娴熟程度有很大关系。如果术者对脑室系统的解剖掌握很好，有多例手术治疗脑积水的经验，操作就会对周围组织影响比较小，手术就会获得成功，患者就几乎没有脑积水的后遗症，所以脑积水的后遗症和术者的操作也有一定的关系。脑积水微创治疗，总体而言后遗症比较小，前提是患者必须接受正规且规范化的治疗。患者选择比较大的规范化医疗中心或者医院进行救治，后遗症就会很小。如果操作出现意外情况，比如术者操作技术不熟练，有异常的血管或者神经未在手术中及时发现，出现损伤，损伤到神经会引发相应的脑功能的障碍，比如神经断裂后，可能患者会出现面部麻木、口角歪斜或者流口水。如果血管出现损伤，小的血管影响不是很大；如果大的动脉血管出现损伤，会导致相应的供血区域出现缺血，病人会出现脑缺血的症状，病情严重的患者可出现意识障碍，也就是昏迷；病情较轻的患者，有轻微的肢体活动功能障碍，轻偏瘫等，主要是看具体损伤发生的部位。