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耐多药肺结核主要采用药物治疗，因对主要的两个抗结核药物异烟肼和利福平产生耐药性，因此杀灭耐药细菌，需增加药物种类。普通结核病需服用4种结核药，而耐多药结核病需5-6种，甚至7-8种抗结核药物联合应用，因抗结核药物使用较多，导致治疗费用增高、副作用增多，并且其治疗疗程较长，24个月，甚至36个月，其中还包括8个月左右的注射剂治疗。