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肠镜主要用于诊断大肠与回肠末端的疾病，若患者出现下腹痛、腹胀、腹部触及包块，或出现便血，或有便秘、腹泻、大便性状改变时，均需行肠镜检查。若有大肠癌家族史，尤其年龄在40岁以上的人群，即使无症状，也需做肠镜检查。多数肠癌为肠息肉演变而来，而肠息肉早期无大便形状改变、腹痛等症状，患者甚至可无任何不适，故需早期筛查。