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脑脓肿可通过药物和外科手段进行治疗。脑脓肿起始阶段，通常通过影像、实验室检查确诊后可针对性使用抗生素治疗。多数患者通过抗生素治疗后，感染灶可得到有效抑制；外科治疗手段有脓肿穿刺引流，适合病灶较深或位于脑功能区者，若为单发脓肿可采用定向或导航引导下进行脓肿穿刺，脓液抽吸后，形置管引流或抗生素冲洗等。脑脓肿切除手术是相对较彻底的治愈手段，主要适合脓肿位置相对表浅或位于非功能区者。部分患者还可进行开放式引流，可起到减压引流的作用。