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胃镜检查通常3-5分钟可结束，根据病人情况，有的病人需要活检则时间稍长。肠镜检查则因人而异，有的病人肠道弯较少，检查时间较短，通常为3-5分钟，有的病人甚至2分钟即可做到回盲瓣。操作时严格要求进镜可以快，但退镜时必须慢，退镜要求不能短于6分钟。病人腹部做过手术或生育次数较多，腹肌无力或肠道弯较多，则检查的时间更长，甚至1小时以上。