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肚脐上方出现疼痛，根据疼痛具体部位不同，其原因有所不同，具体如下：1、来自于腹部皮肤、软组织，如外伤感染性疾病，或病毒感染造成的带状疱疹，均可表现为肚脐上方腹壁皮肤以及深层软组织疼痛。诊断较为困难，通过一段时间休养或抗病毒治疗，病变好转后疼痛可自然消失；2、来自腹腔如小肠、部分大肠以及双侧输尿管等重要组织脏器，出现肠扭转、肠道肿瘤、肠套叠或泌尿系结石可表现为肚脐上方疼痛。肚脐上方从浅到深有皮肤、皮下组织、肌肉，以及腹腔内肠管、系膜、后腹膜等重要组织和器官。通过超声、CT等影像学检查，配合实验室检查和临床症状、体征，大多疼痛可明确诊断其来源。