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病理癌基因或蛋白检测，主要有两个目的，具体如下：1、诊断：因为做肿瘤穿刺活检后，或者通过手术切除下来后送到病理科，首先要确定肿瘤是良性，还是恶性，在确定性质过程中，病理科医生就会做癌基因或者癌蛋白的检测。因为肿瘤细胞会表达特异性癌基因或者癌蛋白，而这些癌基因和蛋白在正常细胞上不存在，所以第一是确定诊断；2、指导治疗：因为现在有很多药物都是靶向药，或者更好的免疫治疗，然而并不是所有病人都适合应用靶向或者免疫治疗，就要通过病理科做基因或蛋白检测进行判断。比如一个蛋白阳性，就可以采用针对此蛋白的靶向药，比如胃癌当中的HER-2，如果是三个加号强阳性，可以用靶向药赫赛汀，其治疗效果较好。有些靶向药测蛋白测不出来，要测基因，例如PD-1单抗，错配修复基因缺陷的病人应用，效果较好。所以可以通过基因和蛋白的检测方式，寻找特效药物。