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脂肪肝本身与肝癌的发生无直接关系，不是肝癌的危险因素。但是在高脂血症、肥胖、暴饮暴食、糖尿病、酒精，以及药物等脂肪肝的形成因素中，部分病因与肝癌病因重叠。如酒精，也是引起肝癌发生的重要因素。长期饮酒导致的脂肪性肝硬化，通过CT、肝穿刺等方式检查，部分可发现肝癌的发生。慢性肝脏疾病肝细胞可发生部分变化，长时间肝脏疾病，可导致肝癌的发生，但脂肪肝一般不会导致肝癌。