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通过妇检、B超、CT 、核磁、肿瘤标志物等检查，以区别子宫肌瘤与卵巢囊肿。子宫肌瘤生长在子宫，妇科检查中，肌瘤可随子宫摇摆而摇摆。在超声影像学检查中肌瘤显示旋涡状结构，而血清肿瘤标志物的检查值不会增高。卵巢囊肿生长在卵巢，与子宫有一定间隙，以囊性偏多，B超的回声偏低、清亮，或清亮有黏稠。巧克力囊肿时，血清肿瘤标志物CA125检查值可显著升高。