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肝内胆管细胞癌主要根据分期决定不同的手术方式，较早期的肿瘤，可距肿瘤大概2cm切除局部，创伤较少，恢复较快，若肿瘤侵犯到肝脏重要的管道，需通过半肝切除达到根治目的，手术范围较大，创伤也较大，还会增加并发症的概率，较晚期的肿瘤伴有血管的侵犯，或淋巴结的转移，手术更复杂，包括血管切除重建、广泛的淋巴结清扫、肝外的胆管切除重建等，出现并发症的概率会更大。