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痰结核菌阴性并不代表患者没有肺结核。肺结核的诊断标准包括咳嗽、咳痰两周以上，并有持续低热症状，以及胸部影像学检查有明确病灶。根据这些症状、体征及影像学检查来综合判断是否有肺结核，综合各项检查若为阴性可诊断为菌阴肺结核。所以并非所有结核病人的痰结核菌检查都是阳性。