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食管癌的病因还未完全明确，大量研究证明有许多因素和食管癌的发生、发展有相对明确的关系。如饮食习惯，进食过烫、过硬、过粗糙的食物，或腌制食物中含有大量的亚硝胺类或真菌成分，都可能是致病因素。同时也和环境因素，包括微量元素的缺乏有关。还有一些不良习惯，如饮酒、抽烟也和食管癌的发生有明显的相关性。另外，食管癌的发病还有家族聚集的倾向，因而遗传因素也起到一个较大的作用。