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导致雌激素偏低的原因其实有很多，具体如下：1、雌激素主要由卵巢合成，如果女性出现了雌激素水平偏低，先要考虑是否是由于卵巢本身的疾病引起，比如染色体所导致的卵巢发育不良，如比较少见的特纳综合征，它是由于染色体异常引起，会导致患者出现生殖器官的发育障碍，卵巢功能下降，这个时候患者的雌激素水平就是低下的；2、另外还要考虑垂体和下丘脑的问题，垂体虽然很小，但是可以左右身体各种激素的分泌，如果出现了垂体瘤，或者是垂体受到损伤、感染、炎症等，就容易导致调节雌激素分泌的促性腺激素水平低下，也会出现雌激素水平偏低；3、另外还有下丘脑的问题，如果下丘脑出现了功能紊乱，重要的GnRH无法脉冲的分泌，也会导致雌激素水平偏低。所以对于雌激素水平偏低的情况，要根据患者的不同情况来具体的分析，针对雌激素水平偏低，目前也是可以使用药物来进行治疗。如可以使用雌激素来进行替代治疗，还有针对下丘脑功能紊乱时，可以使用GnRH的脉冲泵来激素分泌，从而帮助机体调理。