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新型冠状病毒最主要的靶器官损害的部位是肺。当新型冠状病毒通过呼吸道进到人体的肺之后，被感染机体会调动机体免疫系统对感染细胞进行杀灭。免疫系统会使白细胞聚集对感染细胞进行杀灭，同时会使组织液中的巨噬细胞增多，使得血液成分进入到组织液当中。肺组织间隙有很多水分和细胞，所以炎症感染后双侧肺实变变白，肺功能减低甚至无功能。 肺有通气功能、弥散功能，主要是换气功能。感染后主要的表现是干咳，严重者则表现为呼吸困难、血氧饱和度有下降趋势。而咽痛是上呼吸道表现为普通感冒引起上呼吸道感染，比如咽痛、咽、咽部肿胀，所以这两种表现并不一致。