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染色体平衡易位的患者进行三代试管，相比于正常进行试管婴儿的成功率较低。因为平衡易位的患者仅1/18是正常的胚胎，1/18的胚胎是与父母双方相同的平衡易位胚胎，另外16/18的胚胎则是异常胚胎，所以需要大量的胚胎才能够筛选出正常的胚胎，而得到大量囊胚的概率较低。因此，若平衡易位的患者进行三代试管，可能需要反复、多次取卵，才能够得到正常的胚胎。但若患者不进行三代试管而自行备孕，可能会面临多次胎停，对女性的伤害更大。