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一般皮下囊肿有臭味，不一定是发生癌变。这种情况可能是由于癌变而导致的继发感染出现臭味，也可能是良性疾病感染导致的，见于以下情况：1、癌变：首先是癌变导致的皮下囊肿有臭味，皮下囊肿顾名思义是皮下的部分囊性病变，这种病变可能是皮下组织的部分癌症性病变，伴有囊实性的肿块。这种囊性的病变如果继发感染之后，可以出现有臭味的情况，要想明确诊断，就要取得囊实性病变当中实性组织的那一部分，做病理学检查来确诊，或者是将皮下的这种囊实性病变手术切除，送病理去检查，来明确是不是发生癌变的情况，才能更好的进行后续治疗；2、良性疾病感染：其次是良性疾病导致有臭味，皮下囊肿如果囊壁很光滑，也很薄，囊内的囊内液比较清晰，没有明显的这种混杂的声响，可能就是部分良性的病变。但这种囊肿也可能在搔抓、挠破之后继发感染，而导致有臭味的情况，这些良性病变可以通过积极的治疗，而获得根治。