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细菌性龟头炎和霉菌性龟头炎区别，主要包括以下几点：1、病原体：细菌性龟头炎，一般常见大肠杆菌、葡萄球菌、链球菌、肠球菌、绿脓杆菌、包皮杆菌、变形杆菌、克雷伯杆菌等细菌。而霉菌性龟头炎通常是真菌性感染，常见如白色念珠菌；2、症状方面：虽然包皮龟头炎均出现包皮龟头红、肿，以及明显瘙痒、疼痛，但是分泌物性质一般不同。细菌性龟头炎通常有脓性分泌物，伴有明显异味、臭味，而霉菌性龟头炎一般有白色、豆腐渣样大量分泌物增多，且瘙痒更加显著；3、治疗：细菌性龟头炎一般采用抗菌治疗，使用常用抗生素，如头孢菌素、左氧氟沙星、阿奇霉素等进行治疗，口服与外涂均可以，外涂常用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等。霉菌性龟头炎一般采用抗真菌治疗，可以口服氟康唑、伊曲康唑，外涂药物可以使用咪康唑、克霉唑乳膏等。亦可以二者共同进行清洗方面治疗。