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飞秒激光和准分子激光矫正近视的区别体现在以下几点：1、应用的激光模式不同：准分子激光手术用的是准分子激光模式，而飞秒激光用的是飞秒激光模式，这是两种不同的激光，飞秒激光的性能和安全性比准分子激光更好；2、手术的步骤不同：准分子激光分为表层手术和基质手术两种类型，表层手术就是单纯在上皮下完成切削，不用做角膜瓣，有时可能会做一个上皮瓣。而基质手术一定要做一个角膜瓣，做完角膜瓣之后，在角膜瓣下用准分子激光来进行切削。而飞秒激光不需要做瓣，只需要在角膜基质这个部位里面做上下两层的切削，切削完之后形成透镜的形式，然后再通过角膜上的小切口把透镜取出去，所以手术的步骤完全不同；3、后遗症和并发症不同：准分激光由于做了角膜瓣，所以会带来与角膜被切割有关的术后并发症，比如术后的术眼疼痛、视力下降、干眼、夜间视力下降、夜间眩光等。而飞秒激光因为没有做角膜瓣，所以这些与角膜瓣和角膜切削有关的并发症或者后遗症相对较少，可能因为透镜的取出会造成角膜生物力学的改变，会导致角膜功能受到影响，但迄今为止还没有发生特别明显的并发症或者后遗症。